《魔笛》是一部深具哲理意味的德国民族叙事歌剧，上演于1791年，作者于同年逝世。在这部歌剧中，莫扎特运用通俗易懂和引人入胜的神话剧的形式，体现了他的“乌托邦”的理想，即智慧终将战胜愚昧，光明终将战胜黑暗，善良终将战胜邪恶。这部歌剧的剧情十分离奇和稚气，情节的发展也有不合逻辑之处，但歌剧上演后却取得了相当大的成功，这无疑体现了当时的欧洲民众在法国大革命影响下，对“自由、平等、博爱”的向往。故事的中心情节叙述了古埃及一个叫做埃米诺的王子，同他所爱慕的少女帕米娜的爱情经历，他们两人在捕鸟人帕帕杰诺和智慧与光明王国的祭司萨拉斯特罗的帮助之下，在紧急关头依靠魔笛的魔力，经受了种种严峻的考验，最后终成眷属；而代表邪恶势力的夜女王和摩尔人则仓惶地被赶走了。

这部歌剧的序曲非常有名，用奏鸣曲形式写成。整个序曲就好象是一股源源涌出的水流，象征着光明和美好的生活。 《魔笛》第二幕中的一个主题曾被西班牙吉它作曲家、演奏家索尔改编为吉它独奏曲《魔笛主题变奏曲》，成为吉它演奏的最经典曲目之一。

歌剧《魔笛》是莫扎特最后一部也是最伟大的一部歌剧，描述一位王子受夜后委托，带着一支魔笛和一位捕鸟人去神庙解救夜后的女儿。祭司帮助王子认识了夜后的险恶面目，并让王子和少女通过了几道考验后获得了爱情。